Ошибка у покупателя при внесении данных счета-фактуры в базу

Здравствуйте, уважаемые форумчане. В 1 квартале 2016  уже после сдачи отчетности за 3 квартал по НДС, наш покупатель обнаружил, что при вводе в программу данных счета-фактуры, он ошибся на 9 рублей в меньшую сторону по стоимости одной позиции . Уже прошло 3 месяца с момента сдачи отчетности, писем никаких не было из налоговой. Я думаю потому, что вычет занижен, а не завышен. Как исправить ошибку покупателю? Подать уточненку с исправленной суммой за 3 квартал? Или подать в 4 квартале дополнительно на эти 1,37 рублей вычет по тому же номеру счета-фактуры (разбивка вычета по одному счету-фактуре на части в разные налоговые периоды). Но тогда в последнем случае нужно было бы и в декларации за 3 квартал указать полную стоимость товара, или она разбивается на части так же как и сумма НДС? Товар не списан в производство, по налогу на прибыль изменений нет.
А если делать изменения со стороны продавца, какой порядок действий?